一株急性散发性戊型肝炎病毒基因结构及核苷酸同源性分析

作     者：刘子玲 迟宝荣 高桥和明 三代俊治 LIU Zi-ling;CHI Bao-rong;KAZUAKI Takahashi;SHUNJI Mishiro

作者机构：吉林大学第一医院血液科吉林长春130021 吉林大学第一医院消化内科吉林长春130021 日本东芝病院肝病研究所 

出 版 物：《吉林大学学报（医学版）》 (Journal of Jilin University：Medicine Edition)

年 卷 期：2006年第32卷第6期

页      面：1052-1054页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1002[医学-临床医学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：国际合作项目(中国东北地区肝病疫学调研)资助课题(2005-2007年) 

主　　题：肝炎病毒 戊型 基因 结构 病毒 序列同源性 核酸 序列分析 

摘      要：目的：分析一株长春地区散发戊型肝炎病毒（HEV）的基因结构和核苷酸同源性。方法：采用RT—nPCR方法检测HEVRNA，应用全自动测序仪进行序列测定。结果：所获得的HEV-CCC220全长7193bp，编码2397个氨基酸，由5＇-UTR（nt1-9）、3＇-UTR（nt 7152—7193）和3个开放读码框架（ORFs）组成。与HEVIV型核苷酸同源性明显高于HEVⅠ～Ⅲ型，全基因序列核苷酸同源性为83．2％～85．0％；与ORF2间300nt和98nt部分基因序列核苷酸同源性分别为85．0％～93．9％和80．6％～86．7％。结论：长春地区散发性HEV-CCC220属HEVIV型，ORF2间300nt部分核苷酸序列可以代替全基因序列进行HEV基因型分析。