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以绵羊MHC区段BAC克隆酶切片段为探针杂交筛选绵羊混合组织cDNA文库

Screening of tissues pooled cDNA library using probes by restricted fragments of BAC positive clones of ovine MHC

作     者:杨小亮 白大章 邱巍 董慧芹 李大全 陈芳 马润林 Hugh T Blair 高剑峰 YANG Xiao-Liang;BAI Da-Zhang;QIU Wei;DONG Hui-Qin;LI Da-Quan;CHEN Fang;MA Run-Lin;Hugh T Blair;GAO Jian-Feng

作者机构:石河子大学动物科技学院新疆石河子832003 石河子大学生命科学学院新疆石河子832003 中国科学院遗传与发育生物学研究所北京100101 梅西大学兽医动物和生物医学科学研究所 

出 版 物:《遗传》 (Hereditas(Beijing))

年 卷 期:2012年第34卷第7期

页      面:887-894页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 1002[医学-临床医学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基  金:科技部国际合作重大项目(编号:2006DFB33750) 国家重点基础研究发展规划项目(973计划)(编号:2010CB530200)资助 

主  题:绵羊MHC 细菌人工染色体(BAC) cDNA文库 噬菌斑原位杂交 

摘      要:在已知中国美利奴羊MHC(Major histocompatibility complex)区段BAC(Bacterial artificial chromosome)克隆序列信息和预测的基因注释前提下,用位于中国美利奴羊基因组BAC文库MHC区段的6个BAC克隆酶切片段为探针,以噬菌斑原位杂交筛选法筛选中国美利奴羊混合组织cDNA文库(库库杂交),对分离到的cDNA阳性克隆进行全序列测定,并与相应的已知序列信息和基因注释的BAC克隆比对以及在NCBI Blastn数据库中序列相似性检索,旨在验证基因注释结果的准确性和对基因(序列)功能的初步分析。实验中,经过两轮杂交共筛选出27个cDNA阳性克隆(序列),并发现这些序列均可定位到相应的BAC克隆上,且25条序列处在注释基因的外显子部分;在NCBI数据库中经Blastn序列相似性检索发现,23条序列与牛基因的序列相似性最高,且与免疫功能密切相关。

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