天津地区结核分枝杆菌可变串联重复序列多态性研究

作     者：谢彤 巨韩芳 赵德福 穆成 赵慧 吴振萍 王撷秀 XIE Tong;JU Hanfang;ZHAO Defu;MU Cheng;ZHAO Hui;WU Zhenping;WANG Xiexiu

作者机构：天津市疾病预防控制中心300011 

出 版 物：《天津医药》 (Tianjin Medical Journal)

年 卷 期：2010年第38卷第11期

页      面：940-943页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含：心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学] 

基　　金：天津市科委应用基础研究资助项目(项目编号:07JCYBJC08800) 

主　　题：分枝杆菌结核 串联重复序列 基因型 多态现象,遗传 流行病学,分子 天津 

摘      要：目的：分析天津地区流行结核分枝杆菌（MTB）基因组中分布的可变串联重复序列（VNTR）拷贝数目多态性,探讨不同MTB菌株分辨能力强的VNTR基因分型方法。方法：根据VNTR位点PCR扩增产物片段长度分析临床分离的102株MTB菌基因组中22个VNTR位点中重复序列拷贝数目,使用Hunter-Gaston分辨指数（H）评估各个VNTR位点的多态性和VNTR基因分型方法对菌株的综合辨别能力。结果：13个VNTR位点对不同MTB菌株具有较强的分辨能力,其分辨指数达0.9963。其中QUB11b、11a、18、26,MIRU-26、31和Mtub21的多态性较好（H值为0.442~0.699）;MIRU-10、27、39、40,QUB1895和ETR-A位点的多态性尚可（H值为0.203~0.316）;而MIRU-2、4、16、20、23、24,QUB1451,ETR-B和C的多态性差（H值为0.000~0.150）,其中MIRU-2、20、24和QUB1451在北京家族菌株中没有多态性（H=0）。结论：选择多态性好的位点组合可以有效地区分不同的MTB北京家族菌株,建立起菌株分辨能力强的VNTR分型方法。