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印尼3个地区热泉中可培养细菌的分子鉴定与系统发育分析

Molecular Identification and Phylogenetic Analysis of Cultivable Bacteria From Three Hot Springs in Indonesia

作     者:王帅 林学政 黄晓航 ZILDA Dewi Seswita CHASANAH Ekowati WANG Shuai;LIN Xue-Zheng;HUANG Xiao-Hang;ZILDA Dewi Seswita;CHASANAH Ekowati

作者机构:国家海洋局第一海洋研究所海洋生物活性物质重点实验室山东青岛266061 印度尼西亚海洋与渔业研究局海洋生物技术与水产品加工研究中心雅加达印度尼西亚999006 

出 版 物:《海洋科学进展》 (Advances in Marine Science)

年 卷 期:2011年第29卷第3期

页      面:355-363页

学科分类:0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学] 

基  金:中央级公益性科研院所基本科研基金项目--印尼热泉生态系统微生物多样性及其产嗜热酶研究(2010G13) 

主  题:热泉 嗜热细菌 嗜热酶 细菌多样性 限制性片段长度多态性(RFLP) 

摘      要:采用MSM寡营养培养基从印度尼西亚Pantai cermin,Kalianda和Banyu wedang地区的热泉水样、泥样以及沉积物中根据菌落的形态学特征共分离获得69株细菌,通过菌株的16S rDNA的限制性片段长度多态性(PCRRFLP)分析、序列比对和生理生化分析,对其进行鉴定并构建系统发育树。结果表明,分离获得的69株细菌菌株分别属于8种基因型(Ⅰ~Ⅷ),其中1类(基因型I)属于短芽孢杆菌属(Brevibacillus),约占20.28%;1类(基因型Ⅷ)属于地芽孢杆菌属(Geobacillus),约占14.49%;其余6类(基因型Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,Ⅴ,Ⅵ,Ⅶ)均属于芽孢杆菌属(Bacillus),约占总菌株数量的65.22%,为优势菌群。分离获得的8类细菌均为革兰氏阳性兼性好氧菌,接触酶、氧化酶反应均呈阳性,吲哚反应都呈阴性。产酶实验表明,分离到的菌株在中性pH值,37~70℃范围内能够分泌多种耐热的水解酶类,4种基因型(Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ)的菌株分泌蛋白酶,5种基因型(Ⅳ,Ⅴ,Ⅵ,Ⅶ,Ⅷ)的菌株分泌水解脂肪酶,1种基因型(Ⅳ)的菌株分泌淀粉酶,并且发现其中1种基因型(Ⅳ)的芽孢杆菌可同时产生3种水解酶类。利用限制性内切酶AluI对16S rDNA进行的RFLP技术分析结果表明,利用该技术能够对嗜热细菌的16SrDNA多样性进行有效的分析,经凝胶电泳图谱将菌种鉴定到属的水平,揭示了印尼热泉生态系统中蕴藏着丰富的嗜热菌菌种资源。

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