2017年北京市东城区EV-A71和CV-A16分离株VP1基因序列特征分析

作     者：王联君 李艳宇 Wang Lianjun;Li Yanyu Beijing

作者机构：北京市东城区疾病预防控制中心100050 

出 版 物：《中华实验和临床病毒学杂志》 (Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology)

年 卷 期：2018年第32卷第5期

页      面：505-509页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

主　　题：Enterovirus 71 Coxsackievrius A16 VPl基因 进化分析 

摘      要：目的通过分析北京市东城区2017年手足口疑似病例样本中肠道病毒A组71（enterovirus71，EV-A71）和柯萨奇病毒A组16型（coxsackievrius A16，CV—A16）毒株VP1基因序列特征，为手足口病的防治提供基础资料。方法利用RT-PCR法对分离得到的EV—A71和CV—A16VP1序列进行扩增和测序，利用DNAstar5．0和MEGA6．0软件对EV-A71和CV—A16的VP1序列进行比对分析并构建系统发育树。结果2017年东城区共检测手足口疑似病例咽拭子95份，肠道病毒阳性46份（占48．42％）；其中EV—A71阳性4份（占4．21％），CV—A16阳性4份（占4．21％），非EV-A71非CV-A16的其他肠道病毒阳性38份（占40．00％）。4株EV-A71分离株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为92．89％-99．15％和97．32％～98．66％；3株CV—A16分离株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为93．90％～98．76％和98．32％～100．00％。系统进化树显示4株EV—A71属于C4a基因亚型，3株CV—A16属于B1b基因亚型。结论北京市东城区2017年引起手足口病的病原主要以非EV—A71非CV—A16的其他肠道病毒为主，但是EV—A71和CV—A16仍占一定比例。EV—A71毒株属于C4a基因亚型；CV-A16毒株属于B1b基因亚型；与近年来中国大部分地区毒株的基因分型一致；没有检测到新亚型。