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2010~2012年广西壮族自治区HIV-1流行株pol基因亚型的分布情况

Distribution of subtypes of pol gene in HIV-1 epidemic strains in Guangxi Zhuang Autonomous Region, 2010-2012

作     者:王洪 梁冰玉 周波 蒋俊俊 黄颉刚 陈荣风 赵芳凝 王敏连 刘洁 李汶蔚 叶力 梁浩 Wang Hong;Liang Bingyu;Zhou Bo;Jiang Junjun;Huang Jiegang;Chen Rongfeng;Zhao Fangning;Wang Minlian;Liu Jie;Li Wenwei;Ye Li;Liang Hao

作者机构:广西医科大学公共卫生学院广西艾滋病防治研究重点实验室南宁530021 广西艾滋病防治研究重点实验室广西医科大学医学实验中心 

出 版 物:《中华预防医学杂志》 (Chinese Journal of Preventive Medicine)

年 卷 期:2016年第50卷第1期

页      面:79-84页

核心收录:

学科分类:1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 1002[医学-临床医学] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基  金:国家十二五重大专项(2012zxl0004910) 国家自然科学基金(81171624) 国家自然科学基金(31360033) 国家自然科学基金(81360259) 广西自然科学基金(2013GxNsFBA01966) 广西医科大学青年基金(GxMuYsF201344) 

主  题:HIV-1 基因 感染 重组毒株 

摘      要:目的分析广西壮族自治区(广西)HIV-1流行株poz基因亚型的分布情况。方法于2010年1月1日至2012年12月31日,采用方便抽样的方法,在广西11个城市开展调查,通过问卷调查收集调查对象的流行病学资料。纳入标准为:Westernblot确证HIV-1阳性、病毒载量〉1000拷贝/ml、〉18岁及无特殊重大疾病。共招募到调查对象152例。采集每例调查对象5ml外周血并提取病毒基因组RNA,采用巢式RT—PCR扩增病毒pol区全长基因并测序;对所得序列修正后用Genotyping进行初步分型;采用MEGA5.03软件构建系统进化树对pol序列分型进行验证;采用RIP及jpHMMatGOBICS程序分析未知重组毒株的重组断点。结果152例HIV-1感染者共成功扩增出137例pof区全长基因,共获得127例HIV一1亚型判定,其中CRF01_AE占55.9%(71例),CRF08-BC占29.9%(38例),CRF07-BC占10.2%(13例),B(B’)占2.4%(3例),未知重组型占1.6%(2例)。广西11个城市以CRF01-AE亚型流行为主;异性性传播和注射毒品传播感染HIV-1者间CRF01_AE亚型分布差异有统计学意义(X2=15.07,P〈O.001),其比例分别为67.4%(58/86)和34.1%(14/41);21~35、36~60和〉60岁HIV.1感染者中,CRF01_AE亚型所占比例分别为43.6%(17/39)、57.6%(38/66)、77.3%(17/22),CRF_08BC亚型所占比例分别为43.6%(17/39)、28.8%(19/66)、9.1%(2/22),差异有统计学意义(X2=8.48,P=0.014)。2株未知重组型毒株的模式分别为CRF01_AE/B(B’)和CRF01_AE/C/B(B’)重组型。结论2010--2012年广西HIV-1流行株pol基因主要流行亚型为CRF01_AE,以异性性传播为主;出现的未知重组型毒株是由CRF01_AE与CRF_BC重组产生的。

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