利用GEO数据集分析USP51在胃癌中的表达及临床意义

作     者：臧丹 曲秀娟 王硕 郭天舒 杨子长 徐璐 李智 刘云鹏 Zang Dan;Qu Xiujuan;Wang Shuo;Guo Tianshu;Yang Zichang;Xu Lu;Li Zhi;Liu Yunpeng

作者机构：中国医科大学附属第一医院肿瘤内科辽宁沈阳110001 

出 版 物：《现代肿瘤医学》 (Journal of Modern Oncology)

年 卷 期：2018年第26卷第20期

页      面：3252-3256页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(青年科学基金项目)(编号:81302023) 辽宁省高等学校基本科研项目(编号:LFWK201706) 辽宁省中央引导地方科技发展专项资金(编号:2016007010) 沈阳市重点科技研发计划(人口与健康科技研发主题专项)(编号:17-230-9-01) 

主　　题：胃癌 人类肿瘤相关基因表达汇编 USP51 预后 

摘      要：目的:研究USP51在胃癌中的表达情况,探讨USP51表达与胃癌临床病理参数的相关性并预测USP51表达对胃癌预后评估的临床价值。方法:从人类肿瘤相关基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库下载胃癌样本数据集GSE62254的series matrix数据,只保留临床资料和生存信息完整的患者病例,共收录胃癌患者295例。分析不同USP51表达与胃癌临床病理参数的相关性,以及对胃癌预后的影响。采用基因集富集分析方法分析和预测受USP51调控的相关基因。结果:USP51表达水平与胃癌患者年龄、T分期、p TNM分期及Lauren分型均有关(P均 0. 05)。随着USP51表达程度的增加,胃癌患者总生存时间(overall survival,OS)明显缩短(P 0. 001)。USP51高表达富集了黏着斑通路、钙离子信号通路、细胞黏附分子和细胞外基质等相关的基因通路(P 0. 05,FDR 0. 25)。结论:在胃癌中,USP51高表达是一种预后不良因素,推测其可以作为判断胃癌患者预后的有效生物标志物以及治疗靶点。