吉林省2009年手足口病来源的柯萨奇病毒A组16型VP_1编码区基因特征

作     者：常新 周剑惠 刘桂艳 王爽 魏雷雷 曹凤瑞 李大强 周凤岩 康建彪 刘红 阴媛 齐中 

作者机构：吉林省疾病预防控制中心吉林省卫生厅病毒重点实验室长春130062 吉林市疾病预防控制中心吉林吉林132000 长春市疾病预防控制中心吉林长春130033 白城市疾病预防控制中心吉林白城137000 

出 版 物：《中国疫苗和免疫》 (Chinese Journal of Vaccines and Immunization)

年 卷 期：2012年第18卷第6期

页      面：536-540页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：国家科学技术"艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治"重大专项传染病监测技术平台项目"辽宁及周边省市传染病病原谱流行规律研究"课题"吉林省传染病病原谱流行规律研究"子课题(编号:2009ZX10004209-003) 吉林省卫生厅2010年拔尖创新人才培养对象资助经费 

主　　题：手足口病 柯萨奇病毒A组16型 VP1编码区 基因特征 

摘      要：目的分析引起吉林省2009年手足口病(Hand,Footand Mouth Disease,HFMD)流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus Group A Type16,CVA16)VP1编码区的基因特征。方法 对2009年分离于吉林省部分HFMD来源的15株CVA16分离株的VP1编码区基因,进行逆转录-聚合酶链反应扩增,并对扩增产物进行序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件对VP1编码区基因进行基因遗传进化及同源性分析。结果吉林省2009年15株CVA16分离株有86.7%(13/15)属于B1a基因亚型,13.3%(2/15)属于B1b基因亚型,并且15株分离株分属于3个相对独立的传播链(Clade1～3),分别由11株、2株、2株组成。3个传播链各自的组内核苷酸和氨基酸同源性均较高,其中较大优势传播链(Clade1)的核苷酸和氨基酸同源性均高达98.2%～100.0%,两个较小传播链均高达100%。结论吉林省2009年监测到至少有2个基因亚型、3个传播链的CVA16引起的HFMD流行,并且呈现以1个B1a基因亚型的优势传播链为主,其他2个小传播链为辅的传播模式。无论是优势传播链还是小传播链,均各自呈现密切的亲缘关系。