利用线粒体COI和微卫星标记分析文蛤7个地理群体的遗传变异

作     者：李宏俊 张晶晶 袁秀堂 张安国 柳圭泽 邵魁双 王立俊 LI Hongjun;ZHANG Jingjing;YUAN Xiutang;ZHANG Anguo;LIU Guize;SHAO Kuishuang;WANG Lijun

作者机构：国家海洋环境监测中心大连116023 大连海洋大学大连116023 辽宁医学院锦州121001 

出 版 物：《生态学报》 (Acta Ecologica Sinica)

年 卷 期：2016年第36卷第2期

页      面：499-507页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家海洋公益项目(201305043 201305027) 国家自然科学基金项目(31101899) 

主　　题：文蛤 群体遗传变异 细胞色素氧化酶亚基I 微卫星 增殖放流 

摘      要：利用线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)和微卫星标记分析了文蛤7个地理群体(朝鲜新义州,辽宁丹东、蛤蜊岗和盘山,山东东营,江苏如东和启东)的遗传多样性和群体分化。PCR扩增获得142条602 bp的COI核苷酸片段,比对到13个变异位点,包括11个转换和2个颠换,定义了22个单倍型,共享单倍型12个,新义州、丹东和启东群体分别拥有特有单倍型。单倍型多样性最高的是如东群体(h=0.900),最低的是东营群体(h=0.600);核苷酸多样性最高的是丹东群体(π=0.00350),最低的是蛤蜊岗群体(π=0.00115)。基于COI数据的Fu s Fs中性检验和核苷酸不配对分析揭示文蛤种群历史上曾经历过群体扩张事件。分子变异分析(AMOVA)表明,群体内遗传变异占71.64%,群体间遗传变异占28.36%,群体间发生显著的遗传分化(P0.05)。Hardy-Weinberg平衡检验结果显示49个群体-位点组合中有18个偏离平衡(P0.05),表现为杂合子缺失。单倍型邻接(NJ)树显示聚类未展示地域性特色,但某几个同一或者相近地理群体的单倍型具有聚类现象(如东和启东部分单倍型出现地理聚类)。依据群体间遗传距离以Kimura 2-parameter为模型建立UPGMA系统发育树,显示丹东群体和江苏的如东和启东群体聚为一支,暗示江苏苗种的异地养殖已经污染丹东文蛤的遗传背景。