基于EF1-a基因对常见禾本科作物的聚类分析
Cluster Analysis of Some Common Gramineous Plants Based on the Sequences of EF1-a作者机构:洛阳师范学院生命科学系河南洛阳471022 郑州大学河南省离子束生物工程重点实验室河南郑州450052
出 版 物:《郑州大学学报(理学版)》 (Journal of Zhengzhou University:Natural Science Edition)
年 卷 期:2012年第44卷第2期
页 面:108-113页
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种]
摘 要:基于EF1-a基因核苷酸序列和氨基酸序列,利用分子进化遗传分析软件MEGA 5.0构建常见禾本科植物的最小进化法(ME)、邻接法(NJ)和算术平均数的非加权成组配对法(UPGMA)分子系统进化树.研究结果表明,EF1-a cDNA序列和氨基酸序列的聚类分析都能够反映所列禾本科植物的属间关系,3种进化树的聚类分析分支情况基本一致.基于EF1-a基因的cDNA序列和氨基酸序列构建的ME、NJ树适合用来研究禾本科作物种间或种内的遗传关系,而构建的氨基酸序列UPGMA树有待更多的数据研究.