厦门近海海水中多环芳烃降解菌的原位富集与降解菌多样性
In situ enrichment and diversity analysis of polycyclic aromatic carbon degrading bacteria in the coastal seawater of Xiamen Island作者机构:华中农业大学生命科学技术学院农业微生物学国家重点实验室武汉430070 国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室厦门361005
出 版 物:《微生物学报》 (Acta Microbiologica Sinica)
年 卷 期:2010年第50卷第10期
页 面:1392-1398页
核心收录:
学科分类:07[理学] 09[农学] 0903[农学-农业资源与环境] 0713[理学-生态学]
基 金:福建省自然科学基金资助项目(2010J01206) 福建省科技项目(2009H0029) 国家自然科技资源平台项目(2005DKA21209)
摘 要:【目的】为了分析厦门近海原位海水中多环芳烃降解菌的多样性。【方法】将涂有菲的聚氯乙烯(PVC)板悬挂在厦门国际邮轮码头的海水中,进行菲降解菌的原位富集。利用变性梯度凝胶电泳(Denaturinggradient gel electrophoresis,DGGE)和16S rRNA基因文库两种方法分析了在PVC板表面富集微生物的菌群结构。之后,在实验室模拟原位条件下,对PVC板表面富集的菲降解菌群进行进一步富集、分离和初步鉴定。【结果】PVC板在海水中浸没6 d后,16S rRNA基因文库分析表明,在涂菲的PVC板表面富集的菌群中解环菌属(Cycloclasticus)对应的克隆子占文库总克隆子的50%;在未涂菲的PVC板表面吸附的菌群中红杆菌科(Rhodobacteraceae)为优势菌,其对应的克隆子占文库总克隆子的47%;而解环菌属的克隆子只占文库总克隆子的2%。DGGE的分析结果也证明解环菌是菲原位富集降解菌群中的优势菌。实验室进一步富集后,从该菌群中分离鉴定出14株细菌,其中一株新鞘氨醇杆菌B14(Novosphingobium sp.B14)具有菲降解能力。但是,解环菌未能获得纯培养。【结论】菲原位富集发现,厦门近海水体中解环菌是多环芳烃的主要降解菌。