不同基因型HCV膜区(E2)基因克隆及亲、疏水性分析
Cloning of HCV envelop region of different genotype and analysis of their hydrophilicity and hydrophobicity作者机构:中国药品生物制品检定所 北京医科大学微生物学系 瑞典伦德大学马尔默总医院微生物学系
出 版 物:《中华微生物学和免疫学杂志》 (Chinese Journal of Microbiology and Immunology)
年 卷 期:2001年第21卷第2期
页 面:217-220页
核心收录:
学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学]
主 题:丙型肝炎病毒 膜区基因 基因型 变异性 亲水性 疏水性
摘 要:目的 研究丙型肝炎病毒 (HCV)不同基因型膜区序列变异及其变异规律。方法 克隆不同基因型HCV的膜区基因 ,序列测定 ,核苷酸和氨基酸序列比较和分析。结果 不同基因型膜区基因相似性不同 ,从同一血清样本获得的不同克隆间 ,其同源性核苷酸大于 99.2 % ,氨基酸大于99 .9%。相同亚型核苷酸和氨基酸同源性大于 80 %。同型基因核苷酸和氨基酸同源性分别为 (6 3.9~ 75 .0 ) %和 (6 4.9~ 72 .8) %。异型基因同源性核苷酸为 (5 9.4~ 6 7.0 ) % ,氨基酸为 (5 6 .5~ 6 6 .3) %。氨基酸序列变化在某些部位有一定保守性。不同基因HCV高变区 (HVR)的亲水性和疏水性变化小于其下游 3′端区域。结论 HCV基因变化可能有一定规律性。