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野生烟草甲羟戊酸激酶NsyMK基因克隆与序列分析

Cloning and Analysis of a Mevalonate Kinase (NsyMK) Gene in Nicotiana sylvestris

作     者:吕婧 刘贯山 龚达平 孙玉合 

作者机构:中国农业科学院烟草研究所/烟草行业烟草基因资源利用重点实验室山东青岛266101 

出 版 物:《作物杂志》 (Crops)

年 卷 期:2013年第5期

页      面:75-79页

学科分类:09[农学] 0901[农学-作物学] 

基  金:中国农业科学院院长基金(2011011) 

主  题:林烟草 甲羟戊酸激酶 萜类生物合成 

摘      要:甲羟戊酸激酶是植物中控制整个甲羟戊酸途径重要的限速酶,其代谢产物萜类物质是烟草芳香物质的主要来源。本研究采用同源克隆,利用RACE方法获得二倍体林烟草(Nicotiana sylvestris)甲羟戊酸激酶(NsyMK)的开放阅读框序列,对NsyMK序列进行生物信息学分析,预测蛋白理化性质、二级结构、三维结构并推测其结构与功能。结果表明,克隆获得的林烟草NsyMK的开放阅读框全长为1158bp,编码385个氨基酸,预测分子量41.4kDa、等电点为6.05,GenBank登录号KC871597。蛋白质结构分析显示NsyMK存在典型GHMP激酶和甲羟戊酸激酶保守结构域。生物信息学预测NsyMK蛋白不含跨膜区与信号肽。本研究成功克隆并分析了一个未报道的林烟草NsyMK的全长序列,为进一步阐明栽培烟草中萜类代谢途径奠定基础。

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