大花红景天尿苷二磷酸葡萄糖基转移酶基因组DNA的克隆及分析

作     者：常凯 马丽利 王亚雄 兰小中 廖志华 

作者机构：西南大学生命科学学院重庆市甘薯工程技术研究中心重庆400715 西南大学三峡库区教育部生态环境教育部重点实验室重庆400715 西藏农牧学院生物技术教研室西藏林芝860000 

出 版 物：《中草药》 (Chinese Traditional and Herbal Drugs)

年 卷 期：2013年第44卷第6期

页      面：736-743页

核心收录：

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：国家科技支撑计划项目(2011BAI13B06) 重庆市科学技术委员会自然科学基金计划资助项目(2010BB5296) 

主　　题：大花红景天 红景天苷 尿苷二磷酸葡萄糖基转移酶 基因组 启动子 

摘      要：目的克隆大花红景天Rhodiola crenulata尿苷二磷酸葡萄糖基转移酶基因组DNA,并利用生物信息学对其编码区与启动子进行分析。方法以大花红景天为样品,采用优化的CTAB法提取大花红景天基因组DNA,并利用hiTAIR-PCR技术经过3次步移获得大花红景天UDPGT(RcUDPGT)基因DNA序列,并利用生物信息学对其进行分析。结果克隆得到RcUDPGT基因的DNA序列2 977 bp,其中包含1 499 bp的编码区域(包括82 bp的内含子序列)和1 500 bp的编码区5’上游侧翼域序列(包括启动子区域)。生物信息学分析证明该序列为UDPGT基因且与其他植物UDPGT同源,具有亲水性且定位于细胞质中,三级结构预测表明该基因编码的蛋白具有UDPGT功能结合位点。启动子分析表明其存在光响应、厌氧响应、热响应、低温响应、压力与防御响应和花色素苷合成响应元件等。结论克隆的RcUDPGT基因结构完整,具有典型的功能结合位点,为红景天分子生物学与代谢工程研究提供参考。