水样保存方法对青藏高原湖泊可培养微生物的影响
Effect of preservation methods on culturable microorganisms from Tibetan Plateau lake waters作者机构:中国科学院青藏高原研究所高寒生态学与生物多样性重点实验室北京100101 中国科学院大学资源与环境学院北京100190 中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊生物与生态研究室南京210008
出 版 物:《生态学杂志》 (Chinese Journal of Ecology)
年 卷 期:2018年第37卷第8期
页 面:2541-2548页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学]
基 金:科技部基础性工作专项(西藏地区极端特色微生物资源及其多样性研究2015FY110100)资助
摘 要:青藏高原湖水中生存着大量适应极端环境的微生物,如耐冷及嗜冷菌。合适的湖水样品保存方法是野外取样的关键和开展深入研究的前提。本研究对比了冷冻和4℃冷藏两种保存方法对湖水中可培养微生物种类的影响。首先从不同保存方法样品中分离得到纯菌,然后对分离菌的16S rRNA测序进行菌种鉴定。结果表明,自冷冻保存湖水中分离得到7个不同的16S rRNA基因OUT(operational taxonomic unit),冷藏保存水样共分离得到14个不同的16S rRNA基因OTU。冷冻保存水样分离得到的可培养微生物包括芽孢杆菌、简单芽孢杆菌、微小杆菌、不动杆菌、苏云金芽孢杆菌;冷藏保存水样分离得到的微生物包括γ-变形菌、金黄杆菌、芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、寡养单胞菌、假炭疽杆菌、缺陷假单胞菌、细杆菌。研究表明,冷藏保存方法比冷冻保存方法可分离得到更多种类可培养微生物,这两种保存方法均分离得到了芽孢杆菌。