三个品系蛋鸭β2m基因的克隆及多态性研究

作     者：张琳 于森 白俊平 林冬梅 杨少华 黄艳艳 吴家强 蒋万春 Zhang Lin 1, Yu Sen 1 , Bai Junping 1,2 , Lin Dongmei 2, Yang Shaohua 1,Huang Yanyan 1, Wu Jiaqiang 1, Jiang Wanchun 2

作者机构：山东省农业科学院畜牧兽医研究所/山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室山东济南250100 河北工程大学生命科学与食品工程学院河北邯郸056021 

出 版 物：《山东农业科学》 (Shandong Agricultural Sciences)

年 卷 期：2018年第50卷第8期

页      面：142-147页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 0905[农学-畜牧学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：山东省农业科学院青年科研基金项目"鸭病毒性肝炎病毒CTL表位的筛选及其免疫识别研究"(2015YQN55) 山东省农业科学院农业科技创新工程项目"畜禽重要疫病防控关键技术"(CXGC2016B14) "十二五"农村领域国家科技计划项目"禽流感等重要家禽疫病流行毒疫苗研究与开发"(2015BAD12B03) 泰山学者特聘专家工程经费(ts201511069) 

主　　题：鸭 主要组织相容性复合体(MHCⅠ) β微球蛋白(β2m) 多态性 

摘      要：为明确鸭主要组织相容性复合体Ⅰ(major histocompatibility complex,MHCⅠ)β微球蛋白(β2-microglobulin,β2m)分子的多态性和特征,推进相关免疫研究,本试验对我国3个地方品系蛋鸭的多条β2m基因进行克隆,序列经特征分析、同源比对和遗传进化分析后,进行了高变异位点的计算,并将重要变异位点在3D结构上进行了定位。结果表明,鸭β2m基因高度保守,仅个别碱基发生突变,序列中半胱氨酸、免疫球蛋白超基因家族的特征基序Yx Cx Vx H和与重链相互作用的位点均保守性存在;筛选的47条β2m氨基酸序列同源性为95%~100%,完全一致序列普遍存在;鸭β2m氨基酸序列与鸡同源性最高,与鱼类和两栖类最低,结果与遗传进化分析相一致;成熟肽中高变异位点和与重链相互作用的变异位点多位于β折叠上,但不会对β2m的功能产生影响。综合来看,鸭β2m基因保守性高,仅存在一种类型,与MHCⅠ重链的作用方式也相对固定。本试验结果有助于深入理解鸭β2m的分子特性,推动MHCⅠ相关免疫研究的开展。