海南橡胶树暹罗刺盘孢菌群体遗传结构分析

作     者：曹学仁 车海彦 罗大全 CAO Xueren;CHE Haiyan;LUO Daquan

作者机构：中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业部热带作物有害生物综合治理重点实验室海口571101 

出 版 物：《植物保护》 (Plant Protection)

年 卷 期：2018年第44卷第4期

页      面：70-73,86页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 

基　　金：中央级科研院所基本科研业务费专项(2016hzs1J039) 中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金(1630042017003 1630042016029) 

主　　题：橡胶树炭疽病 暹罗刺盘孢菌 ITS序列 群体遗传结构 

摘      要：暹罗刺盘孢菌Colletotrichum siamense是引起海南橡胶树炭疽病的重要病原之一,为了明确海南橡胶树暹罗刺盘孢菌群体的遗传结构,本研究对海南5个市(县)的橡胶树暹罗刺盘孢菌的ITS序列进行分析。结果表明,58个病菌样品可推导出11种单倍型,其中单倍型H11包含样品数最多且在5个市(县)均有分布,其次为单倍型H4,在4个市(县)有分布。遗传分化指数(Fst)表明保亭种群与其他种群的遗传分化较大。AMOVA分析显示,遗传变异主要发生在种群内,占总变异的93.9%。对所有地理种群病原菌ITS序列的核苷酸不配对进行分析,表明病菌未经历过大规模的种群扩张。系统发育分析表明,来自相同地区的病菌单倍型并没有聚在一起。研究结果表明海南橡胶树暹罗刺盘孢菌种群具有丰富的遗传多样性。