采用PCR-DGGE技术分析蒙古羊瘤胃液相和固相细菌的多样性

作     者：曾燕 倪学勤 曾东 简平 王剑 唐雨蕊 ZENG Yan;NI Xue-qin;ZENG Dong;JIAN Ping;WANG Jian;TANG Yu-rui

作者机构：四川农业大学动物医学院/动物疫病与人类健康四川省重点实验室四川雅安625014 

出 版 物：《中国农业大学学报》 (Journal of China Agricultural University)

年 卷 期：2015年第20卷第2期

页      面：131-136页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0903[农学-农业资源与环境] 

基　　金：教育部留学回国人员科研启动基金资助项目(200835-1) 四川省学术带头人培养基金资助 

主　　题：蒙古羊 PCR-DGGE 液相 固相 聚类分析 PCA 

摘      要：为探讨蒙古羊瘤胃液相和固相细菌的多样性,采用变性梯度凝胶电泳技术结合聚合酶链式反应(PCRDGGE)及条带的克隆测序,比较瘤胃液相和固相细菌的差异,同时采用聚类分析和主成分分析(PCA)方法分析瘤胃液相和固相细菌的多样性。结果表明:1)瘤胃液相和固相样品均含有物种丰富的细菌菌群,但液相比固相具有更高的平均条带数,分别为30条和24条;2)瘤胃液相样品比固相样品具有更高的多样性指数、均匀度和丰富度,其数值分别为3.45、0.90和30.20及3.23、0.84和24.62;3)同一动物个体瘤胃液相样品和固相样品聚类在一起,相似性系数均高达0.81;4)共性条带测序结果表明瘤胃的优势细菌主要是Uncultured rumen bacterium和Uncultured Bacteroidetes bacterium,而特异性条带主要是Alcaligenes sp.。不同动物个体的瘤胃液相和固相均含有丰富的细菌菌群,且物种丰富度均较高;同一动物个体的液相与固相相比具有更高的细菌多样性。