基于生物信息学的未分化甲状腺癌关键发病机制及其潜在干预靶点研究

作     者：潘宗富 方琦璐 张轶雯 李莉 黄萍 PAN Zongfu;FANG Qilu;ZHANG Yiwen;LI Li;HUANG Ping

作者机构：浙江省肿瘤医院药剂科浙江杭州310022 浙江省淳安县第一人民医院药剂科浙江杭州311700 

出 版 物：《浙江大学学报（医学版）》 (Journal of Zhejiang University(Medical Sciences))

年 卷 期：2018年第47卷第2期

页      面：187-193页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：浙江省基础公益研究计划(LQ18H160017) 浙江省医药卫生科技计划(2017192848 2018245206) 杭州市卫生科技计划(2017B56) 

主　　题：甲状腺肿瘤/病理生理学 计算生物学 基因表达 信号传导 蛋白质类 基因调控网络 

摘      要：目的:阐明未分化型甲状腺癌(ATC)的分子病理状态,并挖掘其潜在的干预策略。方法:利用GEO数据库联合R语言分析ATC组织与正常甲状腺组织差异表达的基因;利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路数据库和基因本体(GO)数据库对差异表达的基因进行富集和功能注释;基于STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络,分析其关键网络节点和基因簇;最后采用L1000CDS2数据库预测ATC的潜在治疗药物。结果:共获得2087个差异表达基因。与正常甲状腺组织相比,ATC组织细胞内信号通路及肿瘤微环境均发生显著改变,包括PI3K-Akt信号的持续激活、p53通路的激活、炎症反应、细胞外基质重塑等。蛋白质相互作用网络提示存在3个重要的基因簇和9个关键节点。将差异表达基因与L1000CDS2数据库进行比对后发现22个能够逆转ATC病理状态的潜在化合物。结论:本研究揭示了ATC发病机制中的关键节点,为ATC的治疗提供了潜在的靶点。