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消化道微生态标准化样本库共识

Consensus of Standard Biobanking of Gut Microbiome

作     者: 史以超 王子恺 杨云生 

作者机构:中国医药生物技术协会组织生物样本库分会 中国医学装备协会消化病学分会微生态学组及生物样本库学组 中华医学会消化病学分会微生态生物样本库与转化医学协作组 中国人民解放军总医院消化内科 不详 

出 版 物:《胃肠病学》 (Chinese Journal of Gastroenterology)

年 卷 期:2018年第23卷第6期

页      面:356-362页

学科分类:1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含:心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学] 

主  题:肠道微生态 生物样本 消化道 标准化 肠道微生物 患者知情同意 质量控制 信息管理 

摘      要:生物样本库主要是指标准化采集、处理、储存和应用健康和疾病生物体的器官、组织、细胞、血液、体液、分泌物、排泄物以及生物大分子衍生物等各种生物样本,以及与这些样本相关的临床、检验、病理、影像、治疗、随访、患者知情同意等信息,包括质量控制、信息管理与应用系统。人类消化道生存着众多微生物,包括细菌、古生菌、真菌、病毒、原虫等[1]。肠道微生物与宿主长期共同进化,构成肠道微生态,影响着宿主的健康。随着测序等高通量技术和生物信息学的发展,以消化道微生态(主要是细菌和真菌)样本为基础的研究将我们对消化道微生态的认知和应用向前推进了一大步[2],成为国内外重要的研究热点。消化道微生态样本的采集、制备、存储等是后续研究的第一步,对检测和分析结果有着重要的影响[3]。统一标准、高质量的生物样本是研究数据真实性、可重复性、一致性以及整合数据和应用等的基础,也是进行基础和临床大数据研究的重要保障。消化道微生态样本可用于基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、培养组学、营养组学、微生态移植、转化医学等多方面的研究。目前尚缺乏消化道微生态样本库构建的标准和规范,制订相关共识意见非常迫切和必要。

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