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玉米MS22基因生物信息与GRX基因进化分析

Bioinformatics of MS22 Gene and Evolution Analysis of GRX Gene in Maize

作     者:高永钢 郭江波 贾晋 严远鑫 Gao Yonggang;Guo Jiangbo;Jia Jin;Yan Yuanxin

作者机构:内蒙古科技大学分析测试中心包头014010 南京农业大学农学院南京210095 

出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期:2018年第16卷第11期

页      面:3451-3457页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基  金:国家自然科学基金项目(31571580)资助 

主  题:玉米 MS22 谷氧还蛋白家族 生物信息学 

摘      要:谷氧还蛋白(glutaredoxin,GRX)是一类小分子氧化还原酶,在植物生长发育调控及逆境胁迫中起着重要调节作用。本研究拟对玉米MS22基因的生物信息及玉米中GRX基因家族的亲缘进化进行分析研究。通过对MS22基因的生物信息分析,发现MS22基因全长881 bp,编码159个氨基酸,属于CC型谷氧还蛋白。玉米基因组中共鉴定出22个GRX类基因,其中有6个基因为GRX-subⅠ,7个基因属于GRX-subⅡ,9个基因属于GRX-subⅢ。通过聚类分析发现MS22属于GRX-subⅢ类型,该蛋白与不同来源CC型谷氧还蛋白的氨基酸序列保守性较高,一致率介于61%~87%之间。通过该研究对玉米中该类型基因的进一步研究具有较好的理论指导意义。

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