基于Illumina测序分析青海土族牙周病患者可疑致病微生物的组成差异和种群结构

作     者：陈筠 李志艳 赵翀 刘静 张欣 朱德锐 CHEN Yun1, LI Zhi-yan1, ZHAO Chong1, LIU Jing2 ,ZHANG Xin2, ZHU De-rui2

作者机构：青海大学附属医院口腔内科西宁810001 青海大学医学院基础医学研究中心810016 

出 版 物：《中国高原医学与生物学杂志》 (Journal of Chinese High Altitude Medicine & Biology)

年 卷 期：2018年第39卷第2期

页      面：83-88页

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：青海省科技厅应用基础研究计划项目(No.2014ZJ759) 

主　　题：青海 牙周病 土族 高通量测序 致病微生物 

摘      要：目的初步探究青海土族人群中牙周病可疑致病微生物的组成差异和种群结构。方法选择青海省土族居民牙周病样本10例,利用Illumina Mi Seq平台进行细菌16S r RNA基因(V3-V4区)高通量测序,并利用Mothur软件分析微生物的群落结构和多样性。结果基于97%的相似性类聚,获得牙周病组物种注释OTU(Operational taxonomic unit)数目为156个,分类地位明确的细菌属有48个。土族牙周病患者中检出的已知致病微生物种属主要包括消化链球菌属Peptostreptococcus、微单胞菌属Parvimonas、卟啉单胞菌属Porphyromonas、普雷沃菌属Prevotella、拟杆菌属Bacteroides、密螺旋体属Treponema和小类杆菌属Dialister,以及可疑的致病微生物属肠杆菌科未知属Enterobacteriaceae unclassified、希瓦氏菌属Shewanella、克雷伯氏菌Klebsiella、奈瑟氏菌属Neisseria、嗜血杆菌属Haemophilus、乳球菌属Lactococcus、明串珠菌属Leuconostoc、韦荣球菌属Veillonella、普罗维登斯菌属Providencia等。结论青海土族人群中牙周病可疑致病微生物的组成差异较大、种群结构复杂。