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联芳基氨基噻嗪类BACE1抑制剂的3D-QSAR分析与分子对接研究

3D-QSAR Analysis and Molecular Docking Study on Biaryl Aminothiazine BACE1 Inhibitor

作     者:刘景陶 倪敬轩 王晓 毕毅 LIU Jingtao;NI Jingxuan;WANG Xiao;BI Yi

作者机构:河套学院理学系内蒙古巴彦淖尔015000 烟台大学药学院山东烟台264005 

出 版 物:《中国药房》 (China Pharmacy)

年 卷 期:2018年第29卷第10期

页      面:1335-1339页

学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100701[医学-药物化学] 10[医学] 

基  金:2015年度河套学院自然科学重点项目(No.HYZZ201501) 

主  题:联芳基氨基噻嗪类 β-淀粉样前体蛋白水解酶 抑制剂 三维定量构效关系 分子对接 

摘      要:目的:为新型高效联芳基氨基噻嗪类β-淀粉样前体蛋白水解酶1(BACE1)抑制剂的设计合成与新型AD治疗药物研发提供理论基础。方法:选取41个联芳基氨基噻嗪类BACE1抑制剂分子,运用SYBYL-X 2.0软件包,以比较分子场分析法(CoMFA)与比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)构建该类衍生化合物的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型,并以Surflex-dock分子对接方法分析该类化合物与BACE1的结合模式。结果:以CoMFA法和CoMSIA法构建的3D-QSAR模型的交叉验证系数(q^2)均大于0.5,表明其预测能力良好;所建三维等势图能直观反映不同位置引入取代基对化合物活性的影响。Surflex-dock对接分析显示,联芳基氨基噻嗪类分子与BACE1中的ASP80、ASP276、TYR246等氨基酸残基具有氢键作用。结论:基于联芳基氨基噻嗪类衍生化合物所构建的3D-QSAR模型具有良好的预测能力,可指导该类化合物的结构优化;TYR246可能是联芳基氨基噻嗪类抑制剂化合物分子与BACE1结合的另一潜在活性功能残基。通过3D-QSAR分析与分子对接,可进行新型高效联芳基氨基噻嗪类BACE1抑制剂的设计合成,进而用于研发新型AD治疗药物。

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