RNA二级结构的一种新的图形表示及其应用
Analysis of Similarity/Dissimilarity of RNA Secondary Structures Based on a Novel Graphical Representation作者机构：中国海洋大学数学科学学院山东青岛266071
出 版 物：《中国海洋大学学报（自然科学版）》 (Periodical of Ocean University of China)
年 卷 期：2009年第39卷第2期
页 面：349-352,252页
核心收录：
学科分类：071011[理学-生物物理学] 0710[理学-生物学] 07[理学] 070104[理学-应用数学] 0701[理学-数学]
摘 要：生物序列的比对是计算生物学中的1个基本问题。最近有些生物学家给出了RNA二级结构序列的一些3-D和4-D图形表示方法,它们能给出RNA序列的比较直观的表述。文中提出RNA二级结构序列的1种新的图形表示方法。首先依据RNA中碱基分类,将RNA二级结构序列分为8个子序列,并分别对8个子序列建立特征曲线,得到相应的数字指标,构造特征向量,用以进行比对。最后用该方法对9个不同病毒的同一段RNA二级结构序列进行比对以验证其可靠性。
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