苹果茎沟病毒吉林沙果分离物全基因组序列分析

作     者：李正男 张双纳 张尊平 范旭东 任芳 胡国君 董雅凤 LI Zhengnan;ZHANG Shuangna;ZHANG Zunping;FAN Xudong;REN Fang;HU Guojun;DONG Yafeng

作者机构：中国农业科学院果树研究所国家落叶果树脱毒中心辽宁兴城125100 

出 版 物：《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)

年 卷 期：2018年第45卷第4期

页      面：641-649页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 09[农学] 0901[农学-作物学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 0834[工学-风景园林学（可授工学、农学学位）] 

基　　金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610182016017) 中国农业科学院科技创新工程项目(CAAS-ASTIP-2016-RIP) 

主　　题：苹果 苹果茎沟病毒 基因组 系统发育 一致性 重组 

摘      要：通过RT-PCR结合RACE技术扩增到苹果茎沟病毒(Apple stem grooving virus,ASGV)吉林沙果分离物(ASGV-JLSG)全长基因组(登录号:FM616381),共含有6 496个核苷酸(nt),编码两个彼此重叠的开放阅读框(Open reading frame,ORF)。ORF1(37~6 354 nt)编码1个241 k D的多聚蛋白,含有甲基转移酶(Methyltransferase)、木瓜蛋白酶(Papain-like-protease)、解旋酶(Nucleotide triphosphate-binding helicase)、RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase)和C端的外壳蛋白(Coat protein,CP)等结构域。ORF2(4 788~5 750 nt)编码1个36 kD的运动蛋白(Movement protein,MP)。ASGV-JLSG分离物与Gen Bank公布的29个ASGV分离物全基因核苷酸序列一致性为79.20%~86.60%。系统发育分析结果表明,30个ASGV分离物分成2个组,分离物间没有表现出寄主专一性和地理分布规律。重组分析发现,ASGV-JLSG分离物是苹果茎沟病毒黄花梨分离物(ASGV-HH,JN701424)和柑橘碎叶病毒满头红分离物(CTLV-MTHK,C588948)的重组体。本研究中获得的ASGV-JLSG分离物基因组是来源于中国东北地区的首个ASGV基因组序列。