基于网络药理学的紫斑牡丹花、叶抗菌活性和作用机制研究

作     者：包雅婷 王玥 任晓东 黄林芳 曾锐 BAO Ya-ting;WANG Yue;REN Xiao-dong;HUANG Lin-fang;ZENG Rui

作者机构：西南民族大学药学院四川成都610041 加州大学河滨分校化学学院加利福尼亚92521 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193 

出 版 物：《中国中药杂志》 (China Journal of Chinese Materia Medica)

年 卷 期：2018年第43卷第4期

页      面：779-785页

核心收录：

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 1005[医学-中医学] 1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 1002[医学-临床医学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：国家重点研发计划项目(SQ2017YFC170295) 四川省科技厅科技支撑计划项目(2014SZ0131) 四川省基础研究项目(2015JY0009) 国家“十二五”科技支撑计划项目(2012BAI27B07) 国家留学基金委项目(CSC201500850007) 四川省阿坝州应用技术研究与开发项目(YYJS2017004) 西南民族大学研究生创新科学研究项目(CX2017SZ097) 

主　　题：紫斑牡丹 网络药理学 抗菌活性 分子对接 

摘      要：该研究考察紫斑牡丹花、叶的抗菌活性，筛选其抗菌主要活性成分，预测抗菌靶点，探讨其多成分、多靶点抗菌作用机制。首先，采用微量稀释法测定甲醇、乙酸乙酯提取紫斑牡丹花、叶对金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、枯草芽孢杆菌、蜡样芽胞杆菌、大肠杆菌、肺炎克雷伯氏菌、铜绿假单胞菌的最小抑菌浓度（MIC）。其次，利用Uniprot数据库找到相对应的基因靶点，并通过RCSB网站寻找相对应的蛋白亚型的PDBID以及小分子结构为受体，前期已鉴定的紫斑牡丹花、叶化学成分以PubChem等数据库进行结构确认，通过Chem Draw，Avogadro和Discovery Studio Visualizer软件进行配体的构建，采用QuickVina2．0软件进行分子对接。最后，借助Cytoscape3．5．1软件绘制活性成分与抗菌靶点网络图，使用Uniprot在线数据库进行靶点基因功能及代谢通路进行分析。实验结果表明紫斑牡丹花、叶提取物具有抗菌活性，紫斑牡丹花甲醇提取物具有最强的抗菌作用。网络分析表明紫斑牡丹花、叶中筛选得到活性成分29个，抗菌靶点18个。通过紫斑牡丹花、叶活性成分与抗菌靶点网络数的比较，预测其抗菌成分主要是黄酮和酚酸，抗菌机制主要是抑制细菌蛋白的合成。该研究通过体外抗菌实验和网络药理学的筛选，发现紫斑牡丹花、叶提取物具有抗菌活性，为紫斑牡丹花、叶抗菌机制研究提供新的思路和线索。