桑青枯雷尔氏菌gsp G和gsp K基因的获取与生物信息学分析

作     者：禚苏 孔卫青 Zhuo Su;Kong Weiqing

作者机构：安康学院农学与生命科学学院/陕西省蚕桑重点实验室陕西安康725099 

出 版 物：《山东农业科学》 (Shandong Agricultural Sciences)

年 卷 期：2015年第47卷第3期

页      面：9-12页

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 

基　　金：安康学院重点学科研究项目(zdxkzx007) 

主　　题：桑树 青枯雷尔氏菌 Ⅱ型分泌系统 gsp基因 

摘      要：gsp G和gsp K参与青枯雷尔氏菌Ⅱ型分泌系统周质复合体的形成。本研究以桑青枯雷尔氏菌MR111为材料,利用PCR扩增和DNA测序技术成功获得其gsp G和gsp K基因438 bp和843 bp的序列,在线BLAST分析两个基因编码蛋白与其它青枯雷尔氏菌同源区域的相似性在90%以上。在线CDD分析两个蛋白除分别含有典型的T2SG和T2SK以及N端主要由亮氨酸和丙氨酸组成的分泌型信号肽外,gsp G还含Ⅳ型分泌系统的Ⅳ_pilin_GFxxx E结构,而在gsp K中则出现了重复的GIQSTE序列,该序列在雷尔氏菌属中高度保守。