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2014-2016年柳州市甲型H3流感病毒血凝素抗原表位基因变异和进化分析

Evolution and variation of the genes encoding hemagglutinin of influenza A(H3) virus strains circulation in Liuzhou city,2014-2016

作     者:黄萍 余钧池 陈柳军 陈威 HUANG Ping;YU Jun-chi;CHEN Liu-jun;CHEN Wei

作者机构:柳州市疾病预防控制中心微生物检验科 

出 版 物:《现代预防医学》 (Modern Preventive Medicine)

年 卷 期:2017年第44卷第19期

页      面:3602-3605+3610页

学科分类:1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基  金:广西卫生厅自筹课题(E2011265) 

主  题:甲型H3流感病毒 血凝素 基因变异 进化 

摘      要:目的通过分析近年柳州市甲型H3流感病毒HA抗原表位基因突变情况和进化分析,了解其分子流行及变异变迁规律。方法采集2014-2016年柳州市哨点医院以及流感突发疫情病例的呼吸道标本。提取标本核酸后用实时荧光PCR检测,对甲型H3阳性标本扩增血凝素HA基因片段、测序和进行基因变异分析。结果在2014-2016年间总共检测5 164例病例,503例为甲型H3流感病毒阳性。分析2014-2016年柳州市获得的41个甲型H3流感病毒HA基因全长序列的系统进化树发现:2014-2016年间甲型H3流感病毒共引起了3个主要的流感流行峰,且分别属于两个不同的基因簇A/Switzerland/9715293/2013类似株(SW13)为Group1和A/Hong Kong/4801/2014类似株(HK14)Group 2。比较3个流行峰发现血凝素蛋白氨基酸序列出现点突变,主要分布在抗原表位和受体结合位点。结论2014-2016年柳州市流行的甲型H3流感病毒,与当年WHO推荐疫苗株比较出现滞后现象,出现两次明显的抗原漂变,可能是导致柳州市近年来甲型H3流感流行的原因。

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