猪圆环病毒2型GX-FSH株全基因组及ORF2的克隆与结构分析
Cloning and sequence analysis of complete genome and ORF2 gene of porcine circovirus (PCV) type 2作者机构:广西区兽医研究所南宁530001
出 版 物:《广西农业科学》 (Guangxi Agricultural Sciences)
年 卷 期:2007年第38卷第4期
页 面:459-464页
学科分类:090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
摘 要:参考GenBank中猪圆环病毒2型(PCV2)基因的全序列,利用反向PCR技术设计一对特异引物,用PCR方法扩增从本室分离的猪圆环病毒2型GX-FSH株全基因,另设一对引物扩增编码ORF2完整基因,将它们分别连接到pMD 18-T载体,筛选获得重组阳性质粒并对其测序分析。结果表明,所克隆的GX-FSH株全基因序列与Gen-Bank上已发表的部分PCV2毒株全基因序列同源性在94.6%-99.4%之间;相应ORF2开放阅读框的核苷酸同源性在90.0%-99.1%之间,氨基酸序列同源性为90.1%-98.7%;利用生物学软件对ORF2蛋白质结构特征分析,结果提示其成熟蛋白二级结构为β类结构。