MedPortal:面向精准医学的生物医学本体资源存储和应用平台

作     者：郭靖文 杨晟 史涪仁 邵晨 张璐璐 王恒 杨啸林 Guo Jingwen;Yang Sheng;Shi Furen;Shao Chen;Zhang Lulu;Wang Heng;Yang Xiaolin

作者机构：中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院北京100005 

出 版 物：《中国生物医学工程学报》 (Chinese Journal of Biomedical Engineering)

年 卷 期：2017年第36卷第5期

页      面：557-564页

核心收录：

学科分类：0831[工学-生物医学工程（可授工学、理学、医学学位）] 08[工学] 0836[工学-生物工程] 

基　　金：国家国际科技合作专项(2014DFB30030) 

主　　题：生物医学本体 MedPortal 数据库 本体映射 本体注释 

摘      要：在过去10余年中,本体广泛应用于生物医学数据分析、检索、整合和再利用中。本体作为一种特殊类型的数据资源,数据量也在迅速增加。为了促进精准医疗领域数据集的整合,并为国内用户提供本体数据资源服务,构建MedPortal本体资源存储和应用平台。通过复用NCBO BioPortal技术,搭建MedPotal软件框架。遴选精准医学相关本体,建立本体资源库。对原框架中的代码和本体处理工具进行修正和完善,使之能够在本体稳定运行的基础上满足大批量数据的自动化处理。目前,该平台已整合42个生物医学本体,建立了本体之间术语映射关系,通过页面和REST API方式,提供术语检索、本体映射、数据标准化注释等本体应用服务(http://***)。MedPortal本体平台将为生物医学数据整合提供帮助。