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6个小叶锦鸡儿种群叶绿体DNA trnL-trnF序列变异及其遗传结构分析

Chloroplast DNA trnL-trnF Sequence Variation and Genetic Structure of Six Caragana microphylla ***

作     者:孙果丽 高洪文 王学敏 冯光燕 王赞 SUN Guo-li;GAO Hong-wen;WANG Xue-min;FENG Guang-yan;WANG Zan

作者机构:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 

出 版 物:《中国草地学报》 (Chinese Journal of Grassland)

年 卷 期:2015年第37卷第3期

页      面:6-10,25页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基  金:中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-IAS10) 

主  题:小叶锦鸡儿 叶绿体 DNA trnL-trnF序列 变异 遗传结构 

摘      要:以内蒙古6个小叶锦鸡儿种群共123个个体为材料,对小叶锦鸡儿叶绿体基因间隔区trnL-trnF序列进行了测序与分析。结果显示:6个种群123个个体共检测到2处变异位点,一处为1个碱基(GT)替换,一处为5个碱基(GAATG)缺失/插入,共得到3种单倍型;6个种群总的遗传多样性(Hd)为0.626,核苷酸多样性指数(π)为0.00091,同时海拔越高、纬度越低,小叶锦鸡儿种群的Hd和π值越大;种群遗传分化指数为0.4148,表明种群内遗传变异占58.52%,种群间遗传变异占41.48%;基于N-J法构建的小叶锦鸡儿单倍型系统进化树显示,所有单倍型形成了两大单源群;基于最大简约标准的单倍型网络图表明,单倍型H1为古老单倍型,单倍型H2和单倍型H3是较为年轻的单倍型,结合地理分布图初步推测了两个阶梯的进化路线。

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