长链非编码RNA在人退变椎间盘组织中的基因表达谱
Gene expression profiles of long non-coding RNAs in human degenerated intervertebral disc tissue作者机构:上海交通大学附属第一人民医院松江分院上海市松江区中心医院骨科201600 上海交通大学附属第一人民医院骨科
出 版 物:《中华医学杂志》 (National Medical Journal of China)
年 卷 期:2017年第97卷第33期
页 面:2582-2586页
核心收录:
学科分类:1002[医学-临床医学] 100210[医学-外科学(含:普外、骨外、泌尿外、胸心外、神外、整形、烧伤、野战外)] 10[医学]
摘 要:目的探讨长链非编码RNA(1ncRNA)在椎间盘退变(IDD)的表达情况。方法应用人髓核(NP)组织的IncRNA—mRNA芯片。采用生物信息学方法来预测描绘差异性表达的lncRNA的功能及作用。并选择部分lncRNAs和mRNA用于定量实时聚合酶链反应(qRT—PCR)验证。结果在退变椎间盘组织中有差异性表达的总共1570个lncRNA。其中,428个lncRNA的表达水平与正常椎间盘组织相比上调〉2倍,而584个的表达水平下调。生物信息学分析(GO分析和KEGG生物学通路分析)显示,参与调节细胞外基质和凋亡的一些典型途径在这些细胞中异常表达(P〈0.05)。分析增强子样的lncRNA及其附近的编码基因,确定3个lncRNAs为潜在的增强剂。RT—qPCR在退变髓核组织中验证了lncRNA的存在。结论lncRNAs参与椎间盘退变的进展。LncRNA可能是新的候选生物标志物和椎间盘退变潜在的治疗靶标。