三种数字PCR平台对多靶标质粒标准物质的定值
Validation Certified Value of Multi-targets Plasmid Reference Materials by Three Digital PCR Platforms作者机构：上海交通大学生命科学技术学院
出 版 物：《农业生物技术学报》 (Journal of Agricultural Biotechnology)
年 卷 期：2017年第25卷第9期
页 面：1500-1507页
核心收录：
学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学]
基 金：国家转基因生物新品种培育科技重大专项(No.2016ZX08012-003)
主 题：转基因生物 多靶标质粒标准物质 微流控芯片数字PCR QX100 微滴式数字PCR QuantStudio 3D数字PCR
摘 要：数字PCR是一种不依赖于外部标准曲线而对目标DNA/RNA进行绝对定量的测量技术,在转基因生物的定量检测、外源基因拷贝数分析以及标准物质定值方面具有广阔的应用前景。本研究基于3种数字PCR平台:微流控芯片数字PCR（chamber digital PCR,cd PCR）、QX100;微滴数字PCR（droplet digital PCR,dd PCR）和Quant Studio;3D数字PCR（3D digital PCR,3D-d PCR）,分别测定转基因油菜（Brassica campestris）多靶标质粒DNA标准分子p CAN的外源品系特异性序列拷贝数和內源标准基因磷酸烯醇丙酮酸羧化酶基因（phosphoenolpyruvate carboxylase,PEP）拷贝数,二者之比即为p CAN标准分子的特性量值。实验结果表明,三种数字PCR平台对多靶标质粒分子的各靶标的量值测定结果均接近真实值1（copies/copies）,且反应体系稳定,重复性良好,相对标准差（relative standard deviation,RSD）均小于25%,说明这三种数字PCR技术均能准确地对质粒标准物质进行定值。同时,本研究建立的基于cd PCR、dd PCR和3D-d PCR平台的质粒标准物质的定值方法也为其他形式标准物质的定值提供新的方法借鉴。
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