基于TCGA数据乳腺癌组织UBE2T表达临床意义分析
Identification of potential prognostic value of UBE2T expression in breast cancer:a study based on TCGA dataset analysis作者机构:汕头市中心医院肿瘤放疗科广东汕头515031
出 版 物:《中华肿瘤防治杂志》 (Chinese Journal of Cancer Prevention and Treatment)
年 卷 期:2017年第24卷第13期
页 面:901-905,911页
学科分类:1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学]
摘 要:目的既往研究发现,泛素结合酶E2T(ubiquitin-conjugating enzyme E2T,UBE2T)在多种肿瘤中表达升高,然而UBE2T在乳腺癌中是否存在高表达及意义尚不清楚。本研究探讨UBE2T表达水平在乳腺癌中的临床意义和可能的机制。方法从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库下载正常乳腺组织和乳腺癌组织中UBE2T基因mRNA二代测序数据及临床信息资料,分析UBE2T mRNA表达水平与乳腺癌临床病理学参数的相关性及对预后的影响。采用Cox回归多因素分析探讨影响乳腺癌患者预后的因素,采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法预测UBE2T可能的调控通路。结果 UBE2T mRNA在乳腺癌组织中表达量为9.28~3 963.54,中位374.18,显著高于正常乳腺组织中UBE2T表达量8.54~216.13,中位40.44,差异有统计学意义(P0.001),而且UBE2T表达水平与乳腺癌患者年龄、分子分型、T分期、TNM分期、雌激素受体(estrogen receptor,ER)、孕激素受体(progesterone receptor,PR)和人表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)状态以及病理类型存在显著相关,均P0.05。进一步分析发现,UBE2T低表达的患者生存预后优于UBE2T高表达的患者,χ~2=7.490,P=0.006。Cox多因素分析结果表明,年龄、分子分型、N分期、M分期和UBE2T表达水平等均是影响乳腺癌患者预后的独立预后因素,P0.05。GSEA分析表明,UBE2T低表达的组织中存在RIGGINS_TAMOXIFEN_RESISTANCE_DN信号通路(FDR=0.199,P0.001)和ERB2_UP.V1_DN路通(FDR=0.235,P0.001)相关基因富集。结论乳腺癌组织中存在UBE2T mRNA水平表达上调,而且UBE2T的表达水平与患者临床病理因素显著相关,其高表达是乳腺癌预后不良因素,其可作为预后判断的分子标记,是潜在的治疗靶点。