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miR-1246和miR-1261在模拟失重48 h后人肺微血管内皮细胞中的表达及生物信息学分析

Expression of miR-1246 and miR-1261 Induced by 48 h Simulated Weightlessness in Human Pulmonary Microvascular Endothelial Cells and Bioinformatics Analysis

作     者:高原 徐沁 褚孟洋 张丽君 李程飞 石菲 孙喜庆 赵疆东 闫铭 王永春 GAO Yuan;XU Qin;CHU Mengyang;ZHANG Lijun;LI Chengfei;SHI Fei;SUN Xiqing;ZHAO Jiangdong;YAN Ming;WANG Yongchun

作者机构:第四军医大学航空航天医学系航空航天生物动力学教研室陕西西安710032 第四军医大学学员一旅陕西西安710032 第四军医大学西京医院骨科陕西西安710032 

出 版 物:《贵州医科大学学报》 (Journal of Guizhou Medical University)

年 卷 期:2017年第42卷第6期

页      面:639-645页

学科分类:08[工学] 082504[工学-人机与环境工程] 0825[工学-航空宇航科学与技术] 

基  金:国家自然科学基金项目(81372130 81301681 81301581 81471817) 

主  题: 模拟失重 血管内皮细胞 miR-1246 miR-1261 生物信息学 

摘      要:目的:检测模拟失重48 h人肺微血管内皮细胞(HMVEC-L)miR-1246和miR-1261表达的改变,利用生物信息学方法分析预测其靶基因。方法:以回转器行模拟失重效应48 h的HMVEC-L为模拟失重组,同时设正常重力对照组,比较两组细胞miRNA表达谱的变化,应用Real-time PCR检测HMVEC-L细胞miR-1246和miR-1261的表达,通过Target Scan、miRDB和miRanda对miR-1246和miR-1261的靶基因进行预测以及功能注释和通路富集分析。结果:与正常重力对照组比较,模拟失重48 h可引起HMVEC-L细胞中29种miRNA呈现显著差异性表达,miR-1246和miR-1261显著降低,差异有统计学意义(P0.05);生物信息学分析显示miR-1246和miR-1261的靶基因涉及生物过程、分子功能及细胞组成等多种功能,主要参与了磷酸化通路、凋亡相关通路和细胞骨架等相关分子的调控。结论:模拟失重48 h后可引起HMVEC-L细胞miR-1246和miR-1261的表达降低,提示其可能参与了模拟失重后内皮细胞功能异常的调控。

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