miR-1246和miR-1261在模拟失重48 h后人肺微血管内皮细胞中的表达及生物信息学分析
Expression of miR-1246 and miR-1261 Induced by 48 h Simulated Weightlessness in Human Pulmonary Microvascular Endothelial Cells and Bioinformatics Analysis作者机构:第四军医大学航空航天医学系航空航天生物动力学教研室陕西西安710032 第四军医大学学员一旅陕西西安710032 第四军医大学西京医院骨科陕西西安710032
出 版 物:《贵州医科大学学报》 (Journal of Guizhou Medical University)
年 卷 期:2017年第42卷第6期
页 面:639-645页
学科分类:08[工学] 082504[工学-人机与环境工程] 0825[工学-航空宇航科学与技术]
基 金:国家自然科学基金项目(81372130 81301681 81301581 81471817)
主 题:肺 模拟失重 血管内皮细胞 miR-1246 miR-1261 生物信息学
摘 要:目的:检测模拟失重48 h人肺微血管内皮细胞(HMVEC-L)miR-1246和miR-1261表达的改变,利用生物信息学方法分析预测其靶基因。方法:以回转器行模拟失重效应48 h的HMVEC-L为模拟失重组,同时设正常重力对照组,比较两组细胞miRNA表达谱的变化,应用Real-time PCR检测HMVEC-L细胞miR-1246和miR-1261的表达,通过Target Scan、miRDB和miRanda对miR-1246和miR-1261的靶基因进行预测以及功能注释和通路富集分析。结果:与正常重力对照组比较,模拟失重48 h可引起HMVEC-L细胞中29种miRNA呈现显著差异性表达,miR-1246和miR-1261显著降低,差异有统计学意义(P0.05);生物信息学分析显示miR-1246和miR-1261的靶基因涉及生物过程、分子功能及细胞组成等多种功能,主要参与了磷酸化通路、凋亡相关通路和细胞骨架等相关分子的调控。结论:模拟失重48 h后可引起HMVEC-L细胞miR-1246和miR-1261的表达降低,提示其可能参与了模拟失重后内皮细胞功能异常的调控。