糯质与非糯谷子Waxy基因exon4～exon9区间RT-PCR分析

作     者：郭世华 王丹丹 孙宇燕 樊巧利 李涛 任芹勇 Guo Shihua;Wang Dandan;Sun Yuyan;Fan Qiaoli;Li Tao;Ren Qinyong

作者机构：内蒙古农业大学农学院呼和浩特010019 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2017年第15卷第6期

页      面：2228-2235页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：由国家自然科学基金项目(31260328 31560394) 内蒙古自治区自然科学基金项目(2014MS0321) 内蒙古自治区科技计划项目(201502043)共同资助 

主　　题：糯谷子 Waxy基因 序列 RT-PCR SNP 

摘      要：为了明确糯质和非糯谷子Waxy基因c DNA序列变异,为品质育种提供实验依据,以2份糯质和2份非糯谷子为材料,利用特异RT-PCR和序列比对,研究了Waxy基因exon4~exon9区间c DNA序列SNPs及其氨基酸多态性,结果表明,糯质红粘谷(00000537)与白米粘谷的同源性为99.12%,在第163、第192、第245和第358位点检测到4个SNPs;非糯类型丰田501与赤谷4号的同源性为98.9%,在第139、第189、第282、第445和第451位点有5个SNPs。糯质红粘谷(00000537)与非糯品种赤谷4号相似性为98.23%,红粘谷(00000537)在第139、163、189、192、245、358、445和451位点碱基分别为T、G、T、G、G、A、C和A,赤谷4号在上述位点依次分别为C、A、G、A、A、C、T和G。糯质红粘谷(00000537)与非糯品种丰田501的相似性为98.9%,红粘谷(00000537)在163、192、245、282和358位点分别为G、G、G、A和A,丰田501依次分别为A、A、A、G和C。红粘谷(00000537)和赤谷4号exon4~exon9区间的c DNA序列编码的氨基酸序列中,检测出6个氨基酸变异,和丰田501出现3个氨基酸的变异。