猪重要感染病毒蛋白的二级结构、抗原表位分析及三联表位多肽疫苗的重组预测

作     者：刘祥 陈琛 陈春琳 吴三桥 LIU Xiang;CHEN Chen;CHEN Chun-lin;WU San-qiao

作者机构：陕西理工大学中德天然产物研究所陕西省天麻山茱萸工程技术研究中心汉中723001 

出 版 物：《生物学杂志》 (Journal of Biology)

年 卷 期：2017年第34卷第3期

页      面：18-23页

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：陕西省农业科技创新与攻关项目(2016NY-088) 陕西理工大学校级科研项目(SLGKY16-13) 

主　　题：猪病毒 表位疫苗 二级结构分析 抗原分析 

摘      要：为设计猪重要感染病毒的蛋白表位多肽疫苗,选取猪感染病毒的候选疫苗蛋白:猪繁殖与呼吸综合征病毒的GP5蛋白,猪圆环病毒2型的CAP蛋白,猪瘟病毒的E2蛋白。综合ABCpred和Bepi Pred方案,预测候选蛋白的B细胞表位;利用神经网络与量化矩阵法预测蛋白的CTL表位;采用MHC-Ⅱ类分子结合肽在线程序预测蛋白的Th表位。使用SOPMA方法与DNASTAR软件分析候选蛋白的二级结构,进一步验证B/T细胞表位预测结果的准确性。然后,通过Protean程序重组拼接获得的B/T细胞抗原表位。结果显示GP5蛋白具有4个优势B细胞表位,CAP、E2蛋白分别具有5个B细胞表位;GP5、CAP与E2蛋白各具有1个CTL表位;GP5、E2蛋白分别具有2个Th表位,CAP蛋白存在1个Th表位。二级结构分析显示预测获得的B/T细胞表位均处于蛋白易于产生表位的暴露表面、无规则卷曲与转角等位置,验证了B/T细胞表位预测结果的准确性。Protean程序重组拼接获得优势的B/T细胞抗原表位。最终设计获得抗原性较好的猪病毒三联表位多肽,为猪易感病毒的多联疫苗开发奠定基础。