抗SCN位点rhg1与Rhg4在种质资源中的单倍型分析及分子标记开发

作     者：盛碧涵 刘兵 陈秀兰 朱治佳 谭云夫 李文滨 赵雪 韩英鹏 SHENG Bi-han;LIU Bing;CHEN Xiu-lan;ZHU Zhi-jia;TAN Yun-fu;LI Wen-bin;ZHAO Xue;HAN Ying-peng

作者机构：东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室/东北农业大学农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030 

出 版 物：《大豆科学》 (Soybean Science)

年 卷 期：2017年第36卷第3期

页      面：345-350页

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治] 

基　　金：黑龙江省自然科学基金面上项目(C2015011) 国家自然科学基金(31671717) 东北农业大学学术骨干计划项目(15XG04) 黑龙江省博士后项目(LBH-Z15017) 

主　　题：大豆胞囊线虫病 rhg1 Rhg4 微卫星标记 单核苷酸多态性 

摘      要：rhg1和Rhg4是抗大豆胞囊线虫病种质所具有的主要的抗性基因,利用与rhg1和Rhg4位点紧密连锁的SSR标记和SNP标记对15份抗感病大豆种质进行基因分型。结果表明:rhg1位点连锁SSR标记Satt309对抗病种质的检出率为55.56%,Rhg4位点连锁SSR标记Sat_162对抗病种质的检出率为66.67%;rhg1位点序列引物PCR产物630bp位置存在腺嘌呤与胞嘧啶(A/C)突变,感病等位为A碱基,抗病等位为C碱基,在Rhg4位点标记引物SHMT的PCR产物上2 749 bp位置存在胞嘧啶和鸟嘌呤(C/G)突变,感病等位为C碱基,抗病等位为G碱基。rhg1和Rhg4位点内SNP对抗病种质的检出率分别为77.78%和100%。利用高分辨率溶解曲线法设计rhg1和Rhg4位点SNP标记,在扫描温度为65℃起始,60℃保持,94℃终止时可得到理想的分型结果。