大豆β-1,3-葡聚糖酶(GmBG1)及其同源蛋白的生物信息学分析

作     者：张丽 魏崃 唐晓飞 王伟威 于志远 刘丽君 Zhang Li;Wei Lai;Tang Xiaofei;Wang Weiwei;Yu Zhiyuan;Liu Lijun

作者机构：黑龙江省农业科学院大豆研究所哈尔滨150086 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2017年第36卷第3期

页      面：1035-1042页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：黑龙江省留学基金(LC2012L37/C0601) 国家大豆产业技术体系(CARS-04-PS05)共同资助 

主　　题：β-1 3-葡聚糖酶 系统进化分析 基因表达分析 生物信息学 

摘      要：β-1,3-葡聚糖酶是普遍存在于多种生物中的一类多基因家族蛋白,属于PR-2家族蛋白,与植物的生长发育及防御体系有关。克隆和鉴定大豆β-1,3-葡聚糖酶家族基因对大豆抗逆育种具有重要意义。本研究应用生物信息学的方法共筛选获得45个β-1,3-葡聚糖酶基因。结果表明,GmBG1具有典型的β-1,3-葡聚糖酶家族的保守结构域及氨基酸位点,含有347个氨基酸,pI值为8.71,二级结构以ɑ螺旋为主,且N端信号肽为α螺旋结构,属于碱性蛋白。大豆β-1,3-葡聚糖酶家族基因主要在根和花中表达;实时荧光定量PCR分析表明,在腐霉菌***的侵染下GmBG1基因在不同的抗病品种中的表达量存在差异;GmBG1基因在抗病品种中24 h时表达水平最高,而感病品种的该表达量无明显变化;此外抗病品种的该表达量明显高于感病品种。