高通量测序及其在食物网解析中的应用进展
Progress on high-throughput sequencing and its applications in food web analysis作者机构:浙江大学水稻生物学国家重点实验室杭州310058 浙江大学昆虫科学研究所杭州310058 浙江大学农生环学部分析测试中心杭州310058
出 版 物:《生态学报》 (Acta Ecologica Sinica)
年 卷 期:2017年第37卷第8期
页 面:2530-2539页
核心收录:
学科分类:07[理学] 09[农学] 0903[农学-农业资源与环境] 0713[理学-生态学]
基 金:国家科技支撑计划项目(2012BAD19B01) 浙江省自然科学基金项目(LY16C140002) 科技部国家"973"基础重点研究发展规划项目(2010CB126200)
主 题:第二代测序 捕食/植食性动物 营养关系 食物转换 宏条形码技术
摘 要:高通量测序是DNA测序技术发展中的重大突破,它的出现为现代生物科学研究提供了前所未有的机遇,例如基于猎物和寄主植物DNA分子解析生态系统的食物网研究已逐渐成为捕食性动物与植食性动物食物网研究的新型模式。在简要总结Roche 454、Illumina和Ion Torrent为代表的第二代测序技术的原理及最新进展的基础上,综述了近年来利用高通量测序技术在捕食性和植食性动物食物网解析构建研究方面取得的最新进展及存在的问题,以期为探索捕食性和植食性动物的猎物/寄主范围、猎物/寄主转换、资源分配、生物防治、生物保护和生态恢复新方法提供思路和启发。