荣昌猪唾液腺全长cDNA文库的构建及ESTs分析

作     者：甘玲 梅宏远 杨滨宇 GAN Ling

作者机构：西南大学荣昌校区动物医学系重庆荣昌402460 

出 版 物：《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 (Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition))

年 卷 期：2017年第45卷第3期

页      面：17-23页

核心收录：

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31201807) 

主　　题：荣昌猪 唾液腺 全长cDNA文库 LD-PCR SMART技术 表达序列标签 

摘      要：【目的】构建荣昌猪唾液腺全长cDNA文库,并进行部分表达序列标签(ESTs)的测序及分析,为荣昌猪种质资源的保存、开发和挖掘提供重要的分子信息。【方法】以14日龄荣昌猪仔猪为材料,取其唾液腺,采用SMART法构建唾液腺全长cDNA文库,并进行ESTs测序、注释及功能分析。【结果】初级文库滴度为5.88×106PFU/mL,重组率为99.67%,大部分插入片段长度为400~2 000bp。共获得144条有效ESTs序列,共计108条非重复序列,包括23个重叠群和85个单一序列,77(占71.29%)条序列为已知功能基因,31(占28.71%)条为未知功能序列,其中18条为新基因。GO分类和KEGG途径分析结果显示,荣昌猪唾液腺表达基因功能主要包括细胞成分、分子功能和生物学过程3个类群。在细胞成分类群中,细胞外的成分所占比例最高;在分子功能类群中,酶抑制剂活性所占比例最高;而在生物过程类群中,以转运和定位等过程最突出。表达的基因主要参与补足物和凝固级联、百日咳、加压素调控的水再吸收及味觉传导等代谢途径。【结论】成功构建了荣昌猪唾液腺全长cDNA文库,解析了荣昌猪唾液腺的表达特征。