奥利亚罗非鱼3种C型溶菌酶基因的克隆及其序列分析

作     者：禹绍国 叶星 张莉莉 田园园 劳海华 白俊杰 卢迈新 

作者机构：中国水产科学研究院珠江水产研究所 上海海洋大学 广东海洋大学 

出 版 物：《农业生物技术学报》 (Journal of Agricultural Biotechnology)

年 卷 期：2010年第18卷第1期

页      面：66-74页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家科技支撑计划(2006BAD01A1201) 广东省农业攻关项目(2008A020100016) 广东省农业科技重大专项(2003A2010501) 广东省重大科技兴渔项目(A200501B03 A200601B03) 广东省农业领域重点项目(2008A020100016) 农业部948项目(2006-G55)共同资助 

主　　题：奥利亚罗非鱼 C型溶菌酶 蛋白质高级结构 

摘      要：本研究结合RT-PCR和RACE法获得了奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)三种C型溶菌酶基因C-1,C-2和C-3的全长cDNA。3个基因的cDNA分别为581bp、662bp和695bp,各编码143、156和143个氨基酸(GenBank accession No:EU913095,EU913094和EU836689),相互间氨基酸序列的同源性在63.9%～67.8%之间。3个基因均具有与其它物种C型溶菌酶相同的8个保守半胱氨酸残基和2个活性位点Glu35和Asp52,可认为它们均为C型溶菌酶基因。在系统进化树中这3个基因首先与同属高等真骨鱼类的聚类,最后再与低等真骨鱼类的聚类,系统进化关系与传统鱼类分类地位相吻合,显示真骨鱼类C型溶菌酶的进化速度与物种的进化速度基本一致。蛋白分析软件分析显示这3个基因均具有C型溶菌酶的典型结构、相似的蛋白二、三级结构,推测应具有与C型溶菌酶相似的生理功能。但3个基因氨基酸序列间存在一定差异,其中C-1的等电点较低且碱性氨基酸较少,因此3种溶菌酶可能具有生理功能上的差异与分工。