多穗柯转录组分析及黄酮类化合物合成相关基因的挖掘

作     者：宋菊 黄剑 李志栋 龙月红 邢朝斌 SONG Ju HUANG Jian LI Zhi-dong LONG Yue-hong XING Zhao-bin

作者机构：华北理工大学生命科学院河北唐山063000 百色学院农业与食品工程学院广西百色533000 

出 版 物：《中国中药杂志》 (China Journal of Chinese Materia Medica)

年 卷 期：2017年第42卷第4期

页      面：675-679页

核心收录：

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31570683) 河北省教育厅科研项目(QN2014102) 华北理工大学培育基金项目(SP201508) 

主　　题：多穗柯 转录组 高通量测序 黄酮类化合物 

摘      要：多穗柯具有甜味和保健功效,其中黄酮类化物是主要活性物质。为获取多穗柯转录组数据库以及黄酮类化合物生物合成相关基因,该研究用RNA-Seq中的Illumina Hi Seq 4000对多穗柯嫩叶进行转录组测序,共获得6 Gb数据,拼接后得到41 043条Unigene,与7个基因数据库进行比对,可归类于51个GO分类中,涉及到237个KEGG标准代谢通路。找到黄酮合成相关基因28条。通过Micro Satallite(MISA)软件分析筛选到18 161个SSR,其中单碱基重复最丰富,有7 346个。此研究得到大量转录本信息,为多穗柯的分子生物学研究提供了宝贵的转录组数据库资源。