2013-2014年上海市污水中人类肠道病毒的基因型分布

作     者：李云逸 陆菁 王秀芝 杨玉颖 费洁 张莉萍 李智 李崇山 左勇 Li Yunyi;Lu Jing;Wang Xiuzhi;Yang Yuying;Fei Jie;Zhang Liping;Li Zhi;Li Chongshan;Zuo Yong

作者机构：上海交通大学医学院基础医学院200025 上海市疾病预防控制中心病原生物检定所 上海市疾病预防控制中心免疫规划所 上海市嘉定区疾病预防控制中心免疫规划科 上海市闵行区疾病预防控制中心免疫规划科 

出 版 物：《中华预防医学杂志》 (Chinese Journal of Preventive Medicine)

年 卷 期：2017年第51卷第2期

页      面：154-159页

核心收录：

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100402[医学-劳动卫生与环境卫生学] 10[医学] 

基　　金：上海市卫生和计划生育委员会项目(GWTD2015S01、15GWZK0101) 全球健康-盖茨基金项目(OPP1039272) 

主　　题：肠道病毒属 柯萨奇病毒感染 艾可病毒感染 环境监测 

摘      要：目的 分析上海市闵行和嘉定区污水处理厂中人类肠道病毒（HEV）的时间分布特点及其基因分型。方法 于2013—2014年，选取闵行和嘉定区两所污水处理厂入水口作为采样点，每月24—28日采集污水标本1份，每份1 L，共48份。经阴离子膜吸附的方法浓缩，再用牛肉汤洗脱，取上清液并接种RD、HEp-2和L20B细胞进行病毒分离，共分离HEV 249株，其中非脊髓灰质炎病毒（NPEV）185株，脊髓灰质炎病毒（PV）64株（均为疫苗相关株）。通过RT-PCR鉴定基因型，采用Bioedit 7.0.0对VP1核苷酸序列进行序列同源性分析，使用MEGA 5.0软件，通过邻位法构建系统发生树，分析优势株及病毒传播链。结果 185株NPEV中178株鉴定出基因型，包括：柯萨奇B组病毒（CVB）2、3、5基因型，埃可病毒（ECHO）1、3、6、7、11、13、19、20、24、25、30基因型，柯萨奇A组病毒（CVA）4基因型。CVB5和ECHO6是在NPEV分离株中比例较高的两个基因型，分别占33.5%（56株）和24.9%（43株）。闵行区污水水样中HEV分离株主要集中在4—9月份，其中优势株ECHO6主要分布在2013下半年和2014上半年采集水样中，优势株CVB5主要在2013—2014年散在分布。嘉定的ECHO6和CVB5两个优势株的流行趋势与闵行区的基本一致。2013—2014年CVB5形成C6和C8基因亚型2个传播链，而与国外毒株有较大的差异；ECHO6形成C3、C6和D9基因亚型3个传播链，而D9基因亚型在上海属于优势基因亚型，在国内外有一定地域性的传播。结论 2013—2014年上海市污水中的分离到的PV均为疫苗株。HEV优势株为CVB5和ECHO6，其中ECHO6在2013下半年和2014上半年较为流行，CVB5在2014年下半年开始流行。CVB5和ECHO6存在多条传播链的共同流行现象。