中国黄淮海地区玉米杂种优势候选位点的鉴定
Identification of Candidate Loci Associated with Maize Heterosis in Huang-Huai-Hai Region of China作者机构:江苏省农业科学院农业生物技术研究所/江苏省农业生物学重点实验室南京210014 南京市蔬菜科学研究所南京210042 江苏农科种业研究院有限公司南京210014
出 版 物:《玉米科学》 (Journal of Maize Sciences)
年 卷 期:2017年第25卷第1期
页 面:15-23页
核心收录:
主 题:玉米 杂种优势群 群体结构 遗传变异位点 遗传杂合率
摘 要:通过对全基因组重测序数据分析发现120 122个高质量In Del和SNP变异位点,通过这些位点可以将具有不同遗传背景的285份玉米自交系划分为9大类群,包括黄淮海地区两大杂种优势群PA和SPT群。检测PA和SPT群间自交系基因型频率的分布和差异发现,1 251个杂种优势候选位点不均匀分布在玉米10条染色体上,其中,675个位点与42个已报道的杂种优势相关QTLs一致。基于候选位点,对部分黄淮海地区的主栽杂交品种进行杂合性分析,In Del和SNP结果均表明,这些位点的杂合性显著高于其他区域,研究结果验证了本研究获得的候选区域的可靠性,表明这些候选位点的杂合性已被广泛的运用于育种过程中。