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酵母基因组共表达基因簇与其上游顺式作用元件的关系

The Relationship between Yeast Coexpressed Gene Clusters and Their Upstream cis-acting Elements

作     者:解涛 盛泉虎 丁达夫 

作者机构:中国科学院上海生物化学研究所!上海200031 

出 版 物:《生物化学与生物物理学报》 (ACTA BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA SINICA)

年 卷 期:1999年第31卷第6期

页      面:718-722页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基  金:中国科学院“人类基因组计划”资助 

主  题:词频比较法 顺式作用元件 DNA表达图谱 酵母 

摘      要:NA微阵列技术的快速发展开辟了从表达图谱研究基因组功能的新途径。酵母全基因组的测定和基因组表达图谱数据的发表使其成为研究真核基因转录调控机制的首选目标。运用生物信息学的工具研究了酵母基因组中基因上游顺式调控元件与基因组表达图谱的关系。结果表明, 表达紧密关联的同一簇基因都具有若干特异的顺式作用元件, 其表达受到相应反式调控因子的控制。找到的位点中, 一部分与已知顺式作用元件相对应;另一部分可能是新的顺式元件, 可以运用实验手段加以鉴别。这些结果有助于深入理解基因的功能及进一步研究代谢途径与调控网络。

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