干扰素治疗早期乙型肝炎病毒的准种进化

作     者：任玉莲 路遥 张璐 申戈 吴淑玲 常敏 刘如玉 胡蕾苹 吴云忠 谢尧 李明慧 

作者机构：济南市传染病医院 首都医科大学附属北京地坛医院肝病二科(北京市医院管理局重点医学专业发展计划-肝炎专业ZY201402) 

出 版 物：《中国病毒病杂志》 (Chinese Journal of Viral Diseases)

年 卷 期：2016年第6卷第5期

页      面：345-350页

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：北京市科技计划课题(D121100003912001) 

主　　题：肝炎,乙型,慢性 干扰素-α 准种 进化 

摘      要：目的应用生物信息学方法研究干扰素-α(IFN-α)治疗早期乙型肝炎病毒(HBV)全基因组准种进化及其与病毒学应答的关系。方法对16例进入免疫清除期的慢性乙型肝炎患者进行IFN-α抗病毒治疗,治疗12周有6例取得完全病毒学应答,3例部分病毒学应答,7例无应答。分别采集治疗前和治疗12周的患者血清,提取HBV DNA后扩增HBV全基因组,进行分子克隆后测序,对得到的序列进行生物信息学分析从而研究病毒的准种进化。结果除了乙肝病毒前C/C基因,在IFN-α治疗早期无其他基因准种特征的动态变化。治疗前完全应答组前C/C基因氨基酸水平的平均遗传距离[2.868(1.727~5.411)10^(-2)替换数/位点]大于无应答组[0.917(0.449~3.695)10^(-2)替换数/位点](P0.001);部分应答组[1.904(1.272~2.349)10^(-2)替换数/位点]大于无应答组[0.917(0.449~3.695)10^(-2)替换数/位点](P=0.006)。治疗前完全应答组前C/C基因平均非同义替换率[1.410(0.804~3.188)10^(-2)替换数/位点]大于无应答组[0.293(0.205~0.651)10^(-2)替换数/位点](P=0.008);治疗12周部分应答组氨基酸水平平均遗传距离[1.755(0.974~2.172)10^(-2)替换数/位点]大于无应答组[0.869(0.276~1.475)10^(-2)替换数/位点](P=0.047);部分应答组与无应答组在IFN-α作用下病毒进化速率差异无统计学意义(P=0.53)。结论慢性乙型肝炎免疫清除期,前C/C基因氨基酸水平准种多样性高的患者在IFN-α治疗早期更容易取得病毒学应答。