巴西橡胶树CCaMK基因家族成员的鉴定和表达分析

作     者：肖小虎 隋金蕾 戚继艳 秦云霞 黄亚成 唐朝荣 XIAO Xiaohu;SUI JinIei;QI Jiyan;QIN Yunxia;HUANG Yacheng;TANG Chaorong

作者机构：中国热带农业科学院橡胶研究所海南儋州571737 海南大学农学院海南海口570228 

出 版 物：《热带农业科学》 (Chinese Journal of Tropical Agriculture)

年 卷 期：2016年第36卷第12期

页      面：16-20页

学科分类：0907[农学-林学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(No.31400565) 

主　　题：巴西橡胶树 CCaMK 基因家族 结构与进化 表达分析 

摘      要：钙/钙调素依赖型蛋白激酶（CCa MK,calcium-and calmodulin-dependent protein kinase）是一种钙离子结合蛋白,在钙信号传导过程中起重要作用。本研究以已发表的CCa MK序列作为检索序列,对橡胶树和其他5种植物（木薯、水稻、杨树、蓖麻和拟南芥）的基因组和转录组数据进行全面搜索,鉴定得到6个CCa MK基因,其中包括一个橡胶树CCa MK基因,命名为Hb CCa MK1。序列分析发现：5种植物的CCa MK氨基酸序列同源性较高,为73%~94%。基因结构分析发现,Hb CCa MK1和所分析的其他植物CCa MK一样均,含有6个内含子、1个蛋白激酶结构域和3个EF-hand结构域;从结构和进化上看,Hb CCa MK1和蓖麻、木薯2种植物的CCa MK具有较近的亲缘关系;在表达方面,Hb CCa MK1在橡胶树根中表达丰度最高,其次为树叶和花;另外,Hb CCa MK1的表达还与叶片发育、真菌侵染和低温胁迫有关。