四个DNA片段在山茶属分子系统学研究中的应用

作     者：杨俊波 李洪涛 杨世雄 李德铢 杨莹燕 YANG Jun-Bo;LI Hong-Tao;YANG Shi-Xiong;LI De-Zhu;YANG Yun-Yan

作者机构：中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学重点实验室 

出 版 物：《云南植物研究》 (Acta Botanica Yunnanica)

年 卷 期：2006年第28卷第2期

页      面：108-114页

学科分类：0710[理学-生物学] 071001[理学-植物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：科技部国家科技基础条件平台工作项目(2004DKA30430) 云南省科学技术突出贡献奖资助项目(KIBWU20013) 

主　　题：山茶属 DNA序列 进化速率 分子系统学 

摘      要：选取山茶属14个组中的10组21种植物对目前常用于属内种间的4个DNA片段(ITS、waxy、trnLF、rpL16)进行序列测定。结果表明:(1)来自叶绿体基因组的2个片段(trnLF、rpL16)其PCR扩增和测序都很容易,但两者的进化速率都非常慢,序列矩阵只有很少信息位点(trnLF含9个,rpL16为20个),不能提供必要的系统发育信息。(2)来自核基因组的ITS片段其PCR产物比较容易获得,但其序列的测定存在较多问题。(3)waxy是来自核基因组的另一个片段,其PCR扩增因受模板DNA的数量和质量的影响很大而有一定难度,但其进化速率较快,序列矩阵具有较多信息位点(92个),并且在山茶属是单拷贝,这对于解决山茶属这类具有许多近缘物种的类群的系统关系有重要价值。基于tsnLF、rpL16和waxy三组数据所建分子系统树支持山茶属为一单系,但属下系统由于取样等原因有待进一步研究。