陆地棉NF-YB基因家族的全基因组分析

作     者：刘静 徐珍珍 袁娜 郭月 张保龙 杜建厂 LIU Jing;XU Zhenzhen;YUAN Na;GUO Yue;ZHANG Baolong;DU Jianchang

作者机构：江苏省农业科学院农业生物技术研究所江苏省农业生物学重点实验室江苏南京210014 江苏省农业科学院经济作物研究所农业部长江下游棉花和油菜重点实验室江苏南京210014 

出 版 物：《华北农学报》 (Acta Agriculturae Boreali-Sinica)

年 卷 期：2016年第31卷第5期

页      面：21-27页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：江苏省“333”人才工程项目(BRA2013267) 江苏省农业科技自主创新基金项目(CX13(3059)) 棉花生物学国家重点实验室开放课题(CB2016B03) 

主　　题：NF-YB基因家族 陆地棉 生物信息 

摘      要：为了进一步了解NF-YB基因家族结构的功能,利用生物信息学手段,系统研究了陆地棉标准系TM-1基因组中NF-YB基因家族的数目、亚细胞定位、染色体分布、进化关系、基序以及组织表达情况。结果表明:TM-1基因组中共有41个NF-YB基因家族成员,它们含有相同的CBFD_NFYB_HMF结构域,大部分定位到细胞核内;41个NF-YB基因家族成员分布在19条染色体上,其中有19组成员在A亚组和D亚组中表现为直系同源基因;进化树分为Ⅰ和Ⅱ2个小组,每个小组成员间具有相似的基序类型和排列顺序;组织表达分析则发现,在这41个NF-YB基因家族成员中,至少有24个成员可以进行表达,且表现出一定的组织特异性。